海基會與海協會去年6月13日簽署“海峽兩岸包機會談紀要”，雙方各自指定航空公司，從去年7月4日開始實施兩岸每周36班周末包機，臺灣開放8個航點，大陸開放5個航點。

　　去年11月4日，海基會與海協會再簽訂“海峽兩岸空運協議”，將周末包機擴大為平日包機，班機數增加到每周108班，臺灣開放的點不變，大陸增加到21個點。雙方并同意在6個月內實現兩岸定期航班。

　　兩岸定期航班主要交由“小兩會”(臺北市航空運輸商業公會和海峽兩岸航空運輸交流委員會)洽談。“陸委會”主委賴幸媛曾透露，目前協商的重點主要在空運班機正常化，并協商增加班機、航點，全面提升航空運輸效率與服務質量。

　　根據臺灣交通部門估算，目前兩岸108個直航包機航次并無法應付大量往來于兩岸的臺灣旅客與來臺觀光的大陸客。根據航空業者提出的需求，每周需要340個航班，約是現行的3倍。而這個數字，也是這次兩岸定期航班的主要討論焦點。

　　目前雙方在航次上已經大致取得共識，雙方也同意未來直航兩岸的客機，將得以腹艙載貨，這將大幅增加航空公司的收入，也將能使直航班機票價下調。